【開發緣起】
南部科學工業園區於民國84年5月獲行政院核准進行籌設、88年12月經內政部同意辦理新訂特定區計畫，其後由台南縣政府推動總面積達3,282.92公頃的「擬定台南科學工業園區特定區計畫」（以下簡稱「南科特定區」），為加速提供進駐廠商設廠土地，經內政部都委會同意，於90年12月針對園區部分先行發布實施，園區以外地區，則於91年11月發布實施。
特定區計畫擬定時，首創將「浮動分區」與「開發許可」的精神納入實施發展計畫，於新市區建設地區共劃分為15個開發區塊，每一開發區塊面積約為50∼60公頃，並保留土地使用彈性、吸引民間投資開發。從92年間開始進行浮動分區招商，並陸續於93年11月發布實施「變更台南科學工業園區特定區計畫（南科液晶電視及產業支援工業區）」案（涵蓋H、I（部分）、J、K之開發區塊），又於94年10月發布實施「變更台南科學工業園區特定區計畫（新市區建設地區開發區塊L及M）主要計畫」案；而L、M區的開發，成為國內首例採用「BT模式」引入民間資金，並以「專案讓售」方式由民間達到財務平衡，減少政府部門的投資風險及財政負擔之開發方式。
民國99年縣市合併升格後，為避免人口逐漸集中於府城都會地區（包含原臺南市轄區及永康、仁德一帶），南科特定區周邊為溪北地區重要引力發展核，故發展策略上將其聚焦為中臺南發展核心，同時定位為中臺南--新市善化科技基地，依臺南市區域計畫之建議，積極發展科技工業，使產業的上下游鍊結關係可以在空間上進行垂直整合。同時，對於周邊浮動分區之開發，在L、M區已陸續完成土地去化、進入建築開發階段後，103年啟動開發區塊F、G區之細部計畫（刻正辦理區段徵收作業）、106年辦理開發區塊I區之細部計畫（刻正辦理區段徵收公必性評估作業），在都市發展布局上，南科特定區已為平衡溪南、溪北發展之重要觸媒。
另外在科學園區部分，南科管理局於106年間辦理「變更臺南科學工業園區特定區計畫（科學園區部分）（第三次通盤檢討）案」時酌予增加13.61公頃之事業專用區用地，該增量遠不及產業發展需求，依據科技部於107年7月完成之「科學園區未來10年規劃藍圖」亦提出需足夠產業投資進駐之政策目標，因應中美情勢變化、全球高科技產業之布局以及半導體上下游產業聚落完整鍊結之需求，以及吸引高科技就業人才在地宜居之城市競爭力考量，剩餘未辦理之開發區塊A、B、C、D、E、N、O已具辦理之時效性與急迫性。
【開發範圍】
F、G區塊（約100.13公頃）位於台鐵南科站旁，與L、M區基地鄰近，附近有亞蔬中心等國際級研發機構，藉著台鐵、台十七線、南二高交流道、可連接善化、新市等區，都市機能發展完善，深具交通區位及發展優勢。
I區（約20.75公頃）位於樹谷園區東南端，靠近南科園區內群創光電，因鄰近附近城鎮，加上該分區位址與新市區相距不遠，生活服務機能在短期內較易達到服務水準，且因應園區從業人口密集，有相當的住宅需求，發展可期。
本次計畫開發區塊A~E區主要面積合計430.14 公頃，位於特定區（園區部分）西北側外圍；開發區塊N、O 區則位於特定區（園區部分）東側、與開發區塊F、G、L、M 區相隔。
A、B、C（約190.01公頃）三區塊，鄰近中山高安定交流道，往來南北交通便利，東為南科園區，西邊是中山高速公路，南邊隔著公滯一、公滯二與樹谷園區相鄰，北邊以線道178線與開發區塊D為界，新開闢直加弄大道橫跨其中，區塊完整，交通便利。鄰近南科園區及樹谷園區，將提供台南科學園區發展產業之相關聯產業廠商進駐，藉以形成產業群落效應。
D、E（約125.21公頃）二區塊，沿15-25M 道路以北之開發區塊，因鄰近A、B、C 區，除提供基本住宅機能外，亦可配合周邊產業發展，導入介於製造業及服務業之間的2.5級產業，提供金融、保險、餐飲，零售業、服務業、健身休閒以及必要性技術服務、研發、企業總部的用地需求，建構完整的就業及生活服務機能。
N、O區（約114.92公頃）座落於科學工業園區特定區東側，主要聯外道路部分，可藉由15-25M道路（目加溜灣大道）及3-50M道路往東銜接省道台1線後連接國道三號善化交流道，往西銜接省道台19甲線。未來將有效支援南科園區生活服務機能之需求，提供住宅等生活機能。
【都市計畫歷程】
1、91年11月25日「擬定臺南科學工業園區特定區計畫案」發布實施。
2、93年03月01日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（土地使用分區管制要點專案通盤檢討）案」發布實施。
3、93年12月01日「 變更臺南科學工業園區特定區計畫（南科液晶電視及產業支援工業區）案」發布實施。
4、94年10月13日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（新市區建設地區開發區塊L 及M）主要計畫案」發布實施。
5、95年01月27日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（部分農業區為污水處理廠用地、道路用地；污水處理廠用地為農業區、綠地、電力事業用地；電力事業用地為綠地；綠地為計畫範圍外用地；及土地使用分區管制要點增修項目）案」發布實施。
6、95年10月19日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（部分農業研發專用區為電路鐵塔用地）案」發布實施。
7、96年11月23日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（第一次通盤檢討）其中變更內容綜理表第三案」發布實施。
8、97年07月30日 「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（第一次通盤檢討）案」發布實施。
9、100年07月08日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（部分農業區為行政區、宗教專用區）案」發布實施。
10、101年09月28日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（部分農業研發專用區為農業區）案」發布實施。
11、102年04月16日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（部分農業區為道路用地）案」發布實施。
12、104年10月23日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（部分農業區為河川區）（配合豐華村落淹水防護工程）案」發布實施。
13、104年11月16日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（部分農業區為零星工業區、部分零星工業區為綠地）案」發布實施。
14、106年09月13日「變更台南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（部分農業區為自來水事業用地）案」發布實施。
15、107年11月29日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（部分農業區為道路用地、部分高速公路用地為高速公路用地兼供道路用地使用）（配合南科樹谷聯絡道路新建工程）案」發布實施。
16、108年01月09日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（部分農業區為公園兼滯洪池用地）（配合南科永久滯洪池設置計畫）案」發布實施。
17、109年03月30日「變更臺南科學工業園區特定區計畫（不含科學園區部分）（主要計畫及細部計畫分離專案通盤檢討）主要計畫案」發布實施。
18、111年11月17日「變更臺南科學工業園區特定區計畫(不含科學園區部份)(部份農業區為河川區、滯洪池用地、部份高速公路用地為高速公路用地(兼供河川使用)、部份道路用地為河川區(兼供道路使用))(配合鹽水溪排水治理計畫)案」。
【未來展望】
南科所在區域近10年來青壯人口呈現正成長，南科園區就業人口8萬人，待周邊產業用地開發完成後，總就業人口估計將可達12.3萬人。而南科周邊3個行政區，目前設籍人口為11.9萬人，周邊整體開發區可再容納6.4萬人，預估大南科可成為18萬人口的新市鎮，帶動在地產業發展。屆時亦請地方民眾配合開發作業，共同創造未來榮景。