按土地分配作業直接牽涉農民權益，是重劃工作的重心。
辦理土地分配一方面須將個人分散之耕地儘量予以集中，又須遷就原位次，還需要配合標準坵形，兼顧原有面積，加上土地條件優劣不一，位置也有差異，以及土地所有權人重視原有土地等因素，致土地分配為土地重劃過程中最複雜，最艱鉅的工作。
為此，農地重劃條例及其施行細則規定土地分配之原則，以為作業之準據。縣市政府對土地分配結果應督促重劃課（股）長及地政局（科）長對土地分配作業予以檢 查以保障農民切身權益，並規定各縣政府於完成土地分配草圖後，應邀集區內土地所有權人及耕地承租人舉行公聽會，公開說明土地分配情形，並聽取農民意見，以為檢討改進參考。