臺南市南科特定區A、B、C、D、E、N及O區區段徵收案預計自113年5月6日起將陸續以公文通知辦理地上物查估作業，分2梯次委託專業不動產估價師辦理地上物查估作業，請各土地所有權人注意，如地上物非屬土地所有權人所有，請協助一併通知使用人或承租人併同到場確認種類、數量，並攜帶地上物查估通知公文所列相關證明文件，如有疑義請逕洽本局區段徵收科確認。
本案預估於113年第3季完成地上物查估作業，第4季辦理協議價購程序，114年第1季報核區段徵收計畫，陸續於114年及115年分別辦理A、B區產專區交地，並預計於118年進行抵價地配地作業；另為配合南科特定區區段徵收開發，本局於善化公有零售市場2樓成立「南科開發區專案辦公室」（地址：臺南市善化區中山路377號2樓），提供所有權人諮詢服務，歡迎在地民眾就近諮詢。